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解決方案

AFADESI-MSI空間代謝組解決方案

實驗流程

中國(country)醫學科學院藥物研究所天然藥物活性物質與功能國(country)家重點實驗室再帕爾·阿不(No)力孜、賀玖明團隊在(exist)分析化學一(one)區《Analytical Chemistry》期刊發表封面文章,題爲(for)“Mapping Metabolic Networks in the Brain by Ambient Mass Spectrometry Imaging and Metabolomics”的(of)研究成果,采用(use)自主研發的(of)AFADESI-MSI技術,建立了(Got it)一(one)種高靈敏空間代謝組學方法,實現了(Got it)大(big)鼠腦組織中多種類極性内源性代謝物的(of)高覆蓋成像,結合代謝通路分析,全面繪制腦代謝網絡圖譜,揭示了(Got it)東莨菪堿緻大(big)鼠記憶功能障礙模型的(of)代謝改變及其腦微區分布特征。(文章鏈接:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c00467)

研究背景

大(big)腦功能與其複雜的(of)微區結構密切相關。研究腦中分子變化有助于(At)理解中樞神經系統疾病的(of)發病機制,推動藥物研發。質譜成像(MSI)技術具有高靈敏、方便、省時(hour)以(by)及免标記的(of)優勢,已成爲(for)繪制蛋白質、代謝産物和(and)脂質圖譜的(of)強大(big)工具,但高通量成像表征腦中的(of)極性小分子代謝物仍具挑戰。本文對課題組研發的(of)空氣動力輔助離子化質譜成像(AFADESI-MSI)平台進行了(Got it)優化,應用(use)空間分辨代謝組學繪制了(Got it)大(big)鼠腦代謝網絡。

實驗設計

  • 01樣本制備

    SD大(big)鼠腹腔注射2 mg/kg東莨菪堿(給藥組、對照組各3隻),安樂死後取出(out)大(big)腦,用(use)冷凍切片機制成20 μm厚的(of)矢狀切片,相鄰的(of)大(big)腦切片進行H&E和(and)Nissl染色。

  • 02數據采集

    SD大(big)鼠腹腔注射2 mg/kg東莨菪堿(給藥組、對照組各3隻),安樂死後取出(out)大(big)腦,用(use)冷凍切片機制成20 μm厚的(of)矢狀切片,相鄰的(of)大(big)腦切片進行H&E和(and)Nissl染色。

  • 03數據處理與代謝網絡分析

    原始數據轉換後應用(use)MassImager軟件進行可視化。将光學圖像精準匹配感興趣區域的(of)離子強度,獲取差異代謝物信息。通過在(exist)線數據挖掘工具Metaboanalyst完成了(Got it)代謝物的(of)高通量注釋。Cyctoscape用(use)于(At)可視化大(big)腦中的(of)複雜網絡。

  • 04統計分析

    兩組大(big)腦樣本選擇相同的(of)微區進行組織學特征性離子圖像疊加,采用(use)t檢驗(n = 3)進一(one)步驗證數據處理結果。

實驗結果

  • AFADESI-MSI定位腦中極性代謝物

    研究通過優化實驗确定ACN / H2O(8:2)作(do)爲(for)理想的(of)噴霧溶劑。圖像中小腦小葉間隔(約爲(for)78.0 μm)清晰可見,表明AFADESI-MSI的(of)實際空間分辨率小于(At)100 μm。此外,成像結果顯示質量差爲(for)30ppm的(of)兩種代謝物可以(by)得到(arrive)明顯分離,檢測的(of)動态範圍高達1000倍。如圖所示,通過AFADESI-MSI獲得的(of)一(one)些具有代表性的(of)代謝物,離子強度從0~106,其分布特征與腦功能結構高度一(one)緻。

    圖1. AFADESI-MSI和(and)代謝組學繪制大(big)鼠大(big)腦代謝網絡的(of)策略,以(by)及代表性極性内源性代謝物離子圖像。

  • 繪制腦中特定區域分布的(of)極性代謝物圖譜

    實驗通過AFADESI-MSI在(exist)正負離子模式下獲得了(Got it)298和(and)372個(indivual)特征離子圖像。包括氨基酸、核苷酸、碳水化合物、脂肪酸和(and)神經遞質(NTs)等。結果顯示γ-氨基丁酸(GABA)在(exist)中腦、嗅球和(and)下丘腦中信号強度較高;多巴胺(DA)主要(want)集中分布在(exist)紋狀體;組胺(HA)作(do)爲(for)一(one)種興奮性NTs集中在(exist)丘腦和(and)下丘腦中。松果體在(exist)睡眠和(and)光周期調節方面起着重要(want)的(of)作(do)用(use),由于(At)其體積小容易被忽視。實驗在(exist)該區域檢測到(arrive)共106種極性代謝物,發現吲哚乙醛、吲哚、5'-甲基硫代腺苷和(and)褪黑素高表達,且褪黑素上(superior)遊代謝産物血清素(5-HT)在(exist)松果體中也有特定的(of)分布。

    圖2.AFADESI-MSI和(and)MetaboAnalyst獲得的(of)大(big)鼠腦中的(of)代謝網絡。

  • 繪制大(big)鼠腦的(of)微區域代謝網絡

    研究将光學圖像和(and)MSI圖像進行精确疊加,從大(big)腦微區中提取代謝圖譜進行代謝網絡重構。圖中顯示了(Got it)包括谷氨酸代謝、花生(born)四烯酸代謝、葡萄糖代謝、嘌呤代謝、三羧酸循環等在(exist)内的(of)代謝途徑。這(this)些信息有助于(At)在(exist)系統水平上(superior)深入了(Got it)解大(big)腦的(of)代謝活動。如圖3A所示,嘌呤代謝中,AMP和(and)GMP在(exist)大(big)腦皮層和(and)松果體中高表達,但在(exist)胼胝體和(and)穹隆中強度較弱。這(this)些結果表明,代謝物的(of)分布在(exist)大(big)腦中表現出(out)功能區域特異性。

    圖3.AFADESI-MSI獲得大(big)鼠腦内嘌呤代謝途徑及相關代謝産物分布(A)和(and)AMP在(exist)大(big)鼠腦各層的(of)分布(B)。

  • 神經遞質的(of)代謝網絡

    如圖展示了(Got it)NTs及其相關代謝物在(exist)大(big)鼠腦内的(of)分布特征和(and)聯系。結果表明代謝物在(exist)腦微區結構中的(of)代謝速度是(yes)可變的(of),并定義了(Got it)區域内穩态的(of)條件。如組氨酸作(do)爲(for)組胺(HA)的(of)前體在(exist)松果體中分布稍高,而HA僅在(exist)丘腦和(and)下丘腦中觀察到(arrive);HA代謝下遊産物甲基組胺在(exist)丘腦和(and)下丘腦中的(of)分布比HA更廣泛,從而進一(one)步證明了(Got it)代謝網絡的(of)區域多樣性和(and)複雜性。

    圖4.(A)神經遞質及其相關代謝物在(exist)大(big)鼠腦中的(of)分布;(B)神經遞質調節和(and)代謝網絡。

  • 從大(big)鼠腦的(of)代謝網絡映射中發掘空間改變

    研究應用(use)AFADESI-MSI分析了(Got it)對照組和(and)東莨菪堿治療的(of)大(big)鼠腦矢狀切片。顯示了(Got it)差異代謝物在(exist)不(No)同腦微區的(of)含量,如N-甲酰犬尿氨酸、L-色氨酸和(and)5-HTP這(this)三種代謝物同屬于(At)色氨酸代謝通路,表明東莨菪堿擾亂了(Got it)腦區色氨酸代謝過程或相關代謝物的(of)區域間轉運。此外,NTs調節網絡也受到(arrive)了(Got it)幹擾,腦導管内HA和(and)甲基組胺升高, GABA、Glu、谷胱甘肽也發生(born)變化。對給藥組大(big)腦的(of)10個(indivual)微區進行了(Got it)分析,結果在(exist)腦橋中發現16個(indivual)異常代謝物,而在(exist)大(big)腦皮質中發現7個(indivual)異常代謝物,表明腦橋和(and)大(big)腦皮質可能是(yes)對東莨菪堿作(do)用(use)最敏感的(of)區域。

    圖5.東莨菪堿模型大(big)腦中代謝網絡改變。

  • 東莨菪堿治療大(big)鼠學習記憶障礙腦模型的(of)AFADESI-MSI圖像和(and)代謝物統計結果

    如下圖所示,顯示了(Got it)其中幾種異常表達的(of)代謝産物的(of)分布,如腺嘌呤在(exist)小腦皮層發生(born)顯著下調;HA在(exist)腦導水管下調 (圖6A-H)。這(this)些代謝物的(of)相對定量信息進一(one)步表明,藥物效應在(exist)大(big)腦中具有多樣性和(and)區域特異性。基于(At)空間分辨的(of)代謝組學爲(for)發現酶或基因異常提供了(Got it)線索,但要(want)完成完整的(of)代謝網絡分析需要(want)在(exist)蛋白質和(and)基因水平上(superior)進一(one)步驗證。

    圖6.東莨菪堿治療大(big)鼠學習記憶障礙腦模型的(of)AFADESI-MSI圖像和(and)代謝物統計結果(n = 3)。

結論

本研究開發了(Got it)一(one)種針對極性内源性代謝小分子高靈敏、高覆蓋的(of)分子成像方法,通過AFADESI-MSI空間代謝組學分析,全面繪制了(Got it)腦代謝網絡及其空間分布,無需衍生(born)化和(and)複雜的(of)前處理,實現了(Got it)對NTs、核苷酸代謝物、多胺、肌酸等極性分子的(of)可視化,爲(for)腦中生(born)理、病理和(and)藥理過程的(of)機制、功能、以(by)及神經系統中各區域間的(of)相互聯系提供了(Got it)線索和(and)代謝網絡調控研究的(of)新視角。本文運用(use)該方法進一(one)步研究了(Got it)東莨菪堿模型腦的(of)微區代謝變化,結合統計分析,揭示了(Got it)與記憶功能障礙直接相關的(of)代謝通路顯著改變及其微區分布特征。

數據來(Come)源:“質譜成像”微信公衆号

中國(country)醫學科學院藥物研究所天然藥物活性物質與功能國(country)家重點實驗室再帕爾·阿不(No)力孜、賀玖明團隊在(exist)《PNAS》上(superior)發表了(Got it)一(one)篇題爲(for)“Spatially resolved metabolomics to discover tumor-associated metabolic alterations”的(of)研究論文,采用(use)AFADESI-MSI技術,建立了(Got it)空間分辨的(of)原位代謝組學方法,并提出(out)一(one)種“下遊代謝物與上(superior)遊代謝酶關聯” 的(of)研究策略來(Come)表征腫瘤代謝改變;結合免疫組化分析驗證,從代謝物和(and)代謝酶兩個(indivual)層次和(and)組織原位深入探究食管癌的(of)代謝改變,發現并可視化表征了(Got it)食管癌異常的(of)代謝通路及其代謝酶。(文章鏈接:https://doi.org/10.1073/pnas.1808950116)

背景介紹

獨特的(of)代謝模式是(yes)腫瘤細胞區别于(At)正常細胞的(of)重要(want)特征,越來(Come)越多的(of)研究表明,在(exist)腫瘤的(of)發生(born)、發展過程中,腫瘤細胞會發生(born)特定譜式的(of)代謝改變以(by)适應腫瘤生(born)長。對于(At)不(No)同組織來(Come)源的(of)腫瘤細胞,盡管彼此間的(of)基因變異譜千差萬别,但是(yes),幾乎所有的(of)腫瘤都需要(want)通過類似的(of)代謝重編程(Metabolic Reprogramming)來(Come)維持其無限制的(of)細胞增殖。腫瘤代謝的(of)表征能夠爲(for)癌症病理機制研究、腫瘤診療新指标和(and)幹預靶點的(of)發現提供新的(of)契機。然而,到(arrive)目前爲(for)止,如何全面的(of)發現腫瘤的(of)異常代謝,尤其是(yes)如何從代謝物和(and)代謝酶兩個(indivual)層面上(superior)原位地(land)表征腫瘤的(of)異常代謝仍然面臨非常大(big)的(of)困難。

實驗設計

收集256例人(people)鱗片狀食管癌(ESCC)組織标本,包括癌組織、癌旁組織和(and)遠端非癌組織,制成冰凍組織切片。如圖1所示,采用(use)空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質譜成像技術(AFADESI-MSI),采集上(superior)述組織中内源性代謝物及其空間分布信息;對相鄰切片進行HE染色;采用(use)MassImager質譜成像數據處理軟件,使質譜成像圖與HE染色圖匹配重合,按不(No)同組織類型及空間分布提取代謝物輪廓信息;使用(use)SIMCA軟件進行多變量統計分析,篩選出(out)與腫瘤代謝相關的(of)差異代謝物;根據差異代謝物及其鑒定結果富集分析發生(born)變化的(of)代謝通路及推測關鍵代謝酶;采用(use)免疫組化方法檢測鎖定的(of)代謝酶表達,進一(one)步驗證其與代謝标志物是(yes)否具有同樣的(of)空間分布特征。

實驗結果

  • 脯氨酸生(born)物合成上(superior)調

    脯氨酸作(do)爲(for)細胞微環境中的(of)重要(want)氨基酸參與細胞凋亡和(and)自噬,在(exist)癌症代謝中的(of)重要(want)作(do)用(use)得到(arrive)越來(Come)越多的(of)關注。根據256個(indivual)食管癌組織樣本的(of)統計數據,癌區脯氨酸離子強度顯著高于(At)上(superior)皮和(and)肌肉區(P<0.001,圖2C)。采用(use)免疫組化方法檢測與脯氨酸合成相關的(of)關鍵代謝酶吡咯-5-羧酸還原酶2(PYCR2)在(exist)ESCC組織切片中的(of)空間表達,發現PYCR2隻在(exist)癌區表達(圖2e),與食管癌組織中脯氨酸的(of)空間分布一(one)緻。

    圖2 脯氨酸生(born)物合成途徑中關鍵代謝物和(and)代謝酶的(of)原位分析(A)脯氨酸的(of)質譜成像(B)光學-MSI重疊圖像(C)256例鱗片狀食管癌(ESCC)患者癌組織和(and)相鄰上(superior)皮、肌肉組織中脯氨酸水平 ***p<0.001(D)ESCC組織的(of)HE染色圖 (E)不(No)同ESCC組織中PYCR2的(of)表達 CT,癌組織;ET,上(superior)皮組織;MT,肌肉組織

  • 尿苷代謝上(superior)調

    尿苷是(yes)RNA合成的(of)重要(want)核苷前體,也參與嘌呤核苷酸生(born)物合成和(and)碳水化合物代謝。此外,組織中尿苷的(of)水平對于(At)嘧啶類抗代謝藥物的(of)抗腫瘤治療至關重要(want)。研究發現癌組織中尿苷含量高于(At)上(superior)皮組織而低于(At)肌肉組織(P<0.001,圖3 A1和(and)A3),而尿嘧啶的(of)含量在(exist)癌組織中顯著升高(P<0.001,圖3 A2和(and)A4),尿嘧啶/尿苷離子強度比(圖3A6)在(exist)癌區顯著增加,可以(by)作(do)爲(for)區分癌組織與癌旁正常組織的(of)生(born)物标志物。同樣,免疫組化結果顯示催化尿嘧啶生(born)成尿苷的(of)代謝酶尿苷磷酸化酶1(UPase 1)在(exist)癌組織中的(of)表達上(superior)調。

    圖3A 尿苷代謝途徑中關鍵代謝物和(and)代謝酶的(of)原位分析(A1,A2)尿苷和(and)尿嘧啶的(of)質譜成像圖 (A3,A4)256例鱗片狀食管癌(ESCC)患者癌組織和(and)相鄰上(superior)皮、肌肉組織中尿苷和(and)尿嘧啶水平 ***p<0.001(A5)UPase 1介導的(of)尿苷轉換爲(for)尿嘧啶的(of)代謝過程(A6)根據尿嘧啶/尿苷離子強度比值構建的(of)質譜成像圖 (A7)癌組織和(and)相鄰上(superior)皮、肌肉組織中尿苷和(and)尿嘧啶的(of)強度變化(A8)ESCC不(No)同區域UPase 1的(of)表達 CT,癌組織;ET,上(superior)皮組織;MT,肌肉組織

  • 組胺代謝下調

    組氨酸在(exist)組氨酸脫羧酶(HDC)的(of)介導下代謝爲(for)組胺。有越來(Come)越多的(of)證據顯示組胺直接參與緻癌作(do)用(use),可以(by)作(do)爲(for)一(one)種潛在(exist)的(of)細胞保護劑來(Come)改善癌症治療。根據一(one)些研究者的(of)說法,基于(At)組胺的(of)治療能促進癌細胞中DNA損傷、凋亡和(and)衰老并可以(by)顯著增加患癌動物的(of)存活率。在(exist)本研究中,組氨酸和(and)組胺呈現完全相反的(of)空間分布。根據256例食管癌組織樣本的(of)成像數據,組氨酸在(exist)癌組織中顯著上(superior)調而組胺顯著下調。組胺與組氨酸的(of)離子強度差異如圖3B7所示。通過計算組胺與組氨酸的(of)離子強度比,對HDC介導的(of)組氨酸脫羧反應進行了(Got it)研究(3B6),發現腫瘤組織的(of)脫羧率相對于(At)肌肉和(and)上(superior)皮組織較弱。和(and)基于(At)強度比的(of)質譜成像預測的(of)一(one)緻,腫瘤組織的(of)HDC表達水平低于(At)肌肉組織和(and)上(superior)皮組織。


    圖3B 組胺代謝途徑中關鍵代謝物和(and)代謝酶的(of)原位分析 (B1,B2)組氨酸和(and)組胺質譜成像圖(B3,B4)256例鱗片狀食管癌(ESCC)患者癌組織和(and)相鄰上(superior)皮、肌肉組織中組氨酸和(and)組胺水平 (B5)HDC介導的(of)組氨酸轉換爲(for)組胺的(of)代謝過程(B6)根據組胺/組氨酸離子強度比值構建的(of)質譜成像圖(B7)癌組織和(and)相鄰上(superior)皮、肌肉組織中組氨酸和(and)組胺的(of)離子強度變化(B8)ESCC不(No)同區域HDC的(of)表達。此外,發生(born)改變的(of)代謝途徑還有谷氨酸代謝,脂肪酸合成以(by)及多胺的(of)生(born)物合成,均在(exist)腫瘤組織中表現爲(for)顯著增多,相應的(of)免疫組化結果也證明與上(superior)述途徑有關的(of)關鍵代謝酶在(exist)癌區的(of)表達也明顯上(superior)調。以(by)下(表1)爲(for)通過256例食管癌患者組織樣本篩選出(out)的(of)發生(born)改變的(of)6條代謝途徑和(and)相應的(of)關鍵代謝酶:

    表1 篩選出(out)癌症相關的(of)代謝産物、代謝酶、代謝途徑

結論

該研究建立了(Got it)一(one)種高靈敏的(of)空間分辨的(of)原位代謝組學方法,對食管癌潛在(exist)原位标志物進行了(Got it)代謝通路分析,并對通路上(superior)相關聯代謝物的(of)分布特征進行原位可視化表征,分析其空間變化趨勢,發現了(Got it)并驗證了(Got it)6個(indivual)在(exist)食管癌中異常表達的(of)代謝酶:吡咯-5-羧酸還原酶2(PYCR2)、谷氨酰胺酶(GLS)、尿苷磷酸化酶1(UPase1)、組氨酸脫羧酶(HDC)、脂肪酸合成酶(FASN)和(and)鳥氨酸脫羧酶(ODC),它們(them)廣泛參與食管癌相關的(of)腫瘤代謝過程,其中PYCR2和(and)UPase1被首次發現在(exist)食管癌中異常改變。研究結果表明脯氨酸生(born)物合成,谷氨酸代謝,尿苷代謝,組氨酸代謝,脂肪酸合成,多胺生(born)物合成等代謝通路在(exist)食管癌組織中發生(born)了(Got it)顯著變化。這(this)些癌症代謝相關信息有助于(At)增加對癌症代謝重編程的(of)理解。基于(At)AFADESI-MSI技術的(of)空間分辨原位代謝組學方法,不(No)僅可驗證腫瘤原位标志物的(of)可靠性;同時(hour)針對腫瘤等具有複雜結構的(of)組織,它具有原位、無需特殊标記、無需複雜耗時(hour)的(of)前處理及反複染色過程,能夠高通量地(land)發現腫瘤異常變化的(of)代謝通路及其代謝酶等優勢;可從代謝物和(and)代謝酶兩個(indivual)層次全面表征腫瘤的(of)代謝改變并發現其潛在(exist)功能,爲(for)深入探究腫瘤的(of)代謝改變提供了(Got it)全新的(of)研究視角。

數據來(Come)源:“質譜成像”微信公衆号

中國(country)醫學科學院藥物研究所天然藥物活性物質與功能國(country)家重點實驗室再帕爾·阿不(No)力孜、賀玖明團隊在(exist)《Theranostics》上(superior)發表了(Got it)一(one)篇題爲(for)“Evaluation of the tumor-targeting efficiency and intratumor heterogeneity of anticancer drugs using quantitative mass spectrometry imaging”的(of)研究論文,采用(use)空氣動力輔助解吸電噴霧離子化(AFADESI)技術和(and)基于(At)人(people)工神經網絡(ANN)的(of)虛拟校正-定量質譜成像(VC-QMSI)方法,建立了(Got it)針對紫杉醇及其衍生(born)物前藥的(of)體内定量成像方法,爲(for)評估該類藥物的(of)腫瘤靶向效率和(and)瘤内異質性分布提供了(Got it)直觀有效的(of)途徑,也爲(for)靶向抗腫瘤新藥研發提供了(Got it)有力的(of)研究工具。(文章鏈接:doi: 10.7150/thno.41763. eCollection 2020.)

背景介紹

可區分正常組織和(and)腫瘤組織的(of)靶向抗腫瘤藥物開發是(yes)癌症治療研究中的(of)關鍵問題。在(exist)新藥研發的(of)早期,如何快速評估抗癌藥物的(of)腫瘤靶向性非常重要(want),且了(Got it)解藥物在(exist)腫瘤内的(of)異質性分布更具挑戰。開發一(one)種高精度、高靈敏度的(of)定量成像分析方法有望解決這(this)一(one)難題。質譜成像是(yes)一(one)種無需标記的(of)分子成像技術,它可提供有關生(born)物體内藥物和(and)代謝物分布的(of)時(hour)空信息,其在(exist)藥物開發領域的(of)應用(use)正在(exist)迅速增加。紫杉醇具有很強的(of)抗腫瘤活性,但直接用(use)藥常伴随有骨髓抑制、神經毒性等嚴重不(No)良反應;近年來(Come)臨床緻力于(At)對紫杉醇進行結構優化、劑型改造或前體藥物開發,以(by)提高藥物的(of)腫瘤靶向能力,減少副作(do)用(use)。本研究建立了(Got it)紫杉醇及其衍生(born)物前藥的(of)體内定量成像方法,評估了(Got it)該類藥物的(of)腫瘤靶向效率和(and)瘤内異質性分布。

實驗設計

通過構建含已知濃度藥物的(of)模拟生(born)物組織,建立了(Got it)定量質譜成像标準曲線;采用(use)空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質譜成像(AFADESI-MSI)技術,同時(hour)采集藥物、藥物代謝物和(and)内源性代謝物信息;以(by)内源性代謝物爲(for)内标,結合ANN方法,構建了(Got it)生(born)物組織中質譜響應基體效應自動預測與校正的(of)回歸模型,對動物切片的(of)單位像素進行逐一(one)定量,從而建立了(Got it)整體動物體内藥物質譜成像分析方法。将該方法用(use)于(At)評估靜脈注射紫杉醇(PTX)、紫杉醇脂質體(PTX-liposome)和(and)紫杉醇前藥(PTX-R)在(exist)A549細胞異種移植裸鼠中的(of)靶向效率和(and)瘤内的(of)分布異質性。

實驗結果

  • 基于(At)人(people)工神經網絡的(of)虛拟校正-定量質譜成像策略

    該策略的(of)步驟如下:采用(use)含有相同藥量的(of)不(No)同類型的(of)模拟組織,篩選出(out)與藥物響應強度變化緊密相關的(of)内源性代謝物,并建立藥物的(of)相對響應強度(相對校正因子RCF)與内源性代謝物離子強度之間的(of)ANN模型(圖1A)。根據該模型自動預測整體動物切片中每個(indivual)像素的(of)RCF值(RCFpredicted),并根據公式Intensitycal = Intensity /RCFpredicted獲得校正後的(of)藥物響應強度(Intensitycal)。将校正響應值用(use)于(At)構建标準曲線,其線性相關系數從未校正的(of)0.45增至校正後的(of)0.99(圖1C)。 使用(use)校正後的(of)标準曲線确定整體動物體内的(of)藥物絕對含量。此外,該方法利用(use)豐富的(of)内源性代謝物質譜信息,通過機器學習可自動識别動物體内的(of)生(born)理分區(圖1D);它可替代需在(exist)光學或H&E染色指導下的(of)人(people)工分區方法。綜上(superior),VC-QMSI可用(use)于(At)複雜的(of)整體動物樣本中藥物的(of)空間分辨定量分析(圖1E)。

    圖1 VC-QMSI策略在(exist)整體動物組織中準确定位抗腫瘤藥物的(of)過程示意圖 (A)基于(At)内源性代謝物的(of)機器學習方法預測相對校正因子的(of)示意圖 (B)不(No)同器官的(of)相對校正因子成像以(by)及相對校正因子預測值和(and)實測值的(of)比較;縮寫:H心髒,Li肝髒,Sp脾,Lu肺,K腎,Br大(big)腦,M肌肉,Tu腫瘤 (C)以(by)藥物含量-未校正的(of)藥物響應強度構成的(of)标準曲線和(and)以(by)藥物含量-校正後的(of)藥物響應強度構成的(of)虛拟校正标準曲線對比 (D)通過使用(use)K均值和(and)t-SNE聚類分析進行自動像素标記的(of)整體動物分割圖像 (E)整體動物體内藥物定量的(of)可視化結果以(by)及光學圖像

  • PTX在(exist)整體動物中的(of)時(hour)空分布

    PTX組和(and)PTX-liposome組:PTX在(exist)動物體内呈廣泛分布,在(exist)心、肝、脾、肺、腎、肌肉、腸、胃和(and)腫瘤組織中均有分布;在(exist)健康組織中的(of)含量遠高于(At)PTX-R組;給藥後期可觀察到(arrive)PTX在(exist)胃腸道中大(big)量積累,而在(exist)腎組織中幾乎不(No)見,提示PTX可能主要(want)通過膽汁-糞便途徑排洩。PTX-R組:與前兩組的(of)廣泛分布不(No)同,PTX-R主要(want)分布于(At)腫瘤組織,其次是(yes)肺和(and)腸。三組小鼠腦中均沒有明顯的(of)藥物分布。就24h内的(of)腫瘤組織藥物暴露量而言,PTX-R組與PTX-liposome組相當,是(yes)PTX組的(of)2倍;以(by)PTX組爲(for)參比,PTX-R組的(of)相對靶向效率(RTE)是(yes)PTX-liposome組的(of)近50倍。以(by)上(superior)證明PTX-R有良好的(of)腫瘤靶向能力。

    圖2 三個(indivual)給藥組在(exist)不(No)同時(hour)間點的(of)AFADESI-MSI可視圖(A)PTX在(exist)整體動物體内的(of)時(hour)空和(and)定量分布(B)PTX在(exist)腫瘤組織中的(of)時(hour)空和(and)定量分布

  • PTX-R的(of)瘤内異質分布

    腫瘤根據形态學的(of)異質性可分爲(for)不(No)同的(of)微區(圖A,B)。基于(At)代謝物特征采用(use)t-SNE和(and)k-means等手段得到(arrive)的(of)腫瘤微區自動識别的(of)結果(圖C)與H&E染色結果(圖A)高度一(one)緻。PTX-R在(exist)腫瘤壞死區域和(and)膠原蛋白區域的(of)含量明顯高于(At)腫瘤薄壁組織區域(圖D,E, F),表明PTX-R具有出(out)色的(of)腫瘤穿透能力。對比腫瘤的(of)薄壁組織和(and)間質區域,PTX-R更多地(land)積累于(At)腫瘤中未明顯分化的(of)區域,比如腫瘤的(of)膠原蛋白區域和(and)脂肪組織。這(this)種藥物在(exist)腫瘤微區分布的(of)異質性值得進一(one)步研究,它對于(At)認識腫瘤的(of)生(born)長、侵襲、對藥物的(of)敏感性以(by)及預後均有重要(want)作(do)用(use)。

    圖3 PTX-R在(exist)瘤内的(of)異質分布(A)腫瘤組織的(of)H&E染色圖像(B)放大(big)倍數(×20)的(of)代表性腫瘤微區(C)基于(At)代謝物譜的(of)腫瘤微區的(of)t-SNE空間分布(D)PTX-R在(exist)腫瘤微區中的(of)分布(E)藥物離子成像和(and)H&E染色成像之間的(of)耦合匹配疊加圖(F)腫瘤微區中PTX-R的(of)定量分布

結論

采用(use)無需标記的(of)AFADESI和(and)VC-QMSI技術成功建立了(Got it)針對紫杉醇及其前藥的(of)定量質譜成像方法,評估了(Got it)該類抗腫瘤藥物的(of)腫瘤靶向效率和(and)瘤内分布異質性,并提供了(Got it)直觀的(of)實驗證據表明設計的(of)紫杉醇前藥具備優異的(of)腫瘤蓄積能力和(and)低全身毒性。進一(one)步證明AFADESI-MSI技術具有高靈敏和(and)寬覆蓋的(of)特點,可在(exist)整體動物的(of)體内微區同時(hour)可視化各種類型的(of)藥物、代謝物和(and)内源性代謝物。VC-QMSI方法将内源性代謝物作(do)爲(for)内标,建立ANN模型;根據模型預測每個(indivual)像素的(of)RCF值,并校正藥物離子強度,從而實現藥物在(exist)整體動物和(and)亞器官組織中的(of)定量可視化。紫杉醇前藥及其代謝物的(of)體内定量分布研究有助于(At)從藥物的(of)保留、消除、靶向和(and)釋放四個(indivual)角度設計有效的(of)腫瘤靶向藥物。所建方法有助于(At)預測與藥物分布相關的(of)藥效和(and)安全性,在(exist)抗腫瘤藥物研發早期進行直接快速的(of)藥效篩查,減少損耗、降低成本。此外,本研究對闡明藥物的(of)功效、毒性和(and)耐藥性提供了(Got it)一(one)個(indivual)深入的(of)視角,有助于(At)抗腫瘤藥物的(of)設計和(and)優化。

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